灰斑
危害特點：大豆灰斑病主要為害成株期葉片，也可侵染幼苗、莖、莢和種子。病粒出生的幼苗子葉上出現半圓或圓形褐色病斑。成株期葉片上的病斑最初為退綠圓斑，逐漸發展成為邊緣褐色、中央灰色或灰褐色的蛙眼狀斑，故又名蛙眼病。后期也可形成不規則形病斑。潮濕時葉背面病斑中央部分密生灰色霉層，為病菌的分生孢子。嚴重時病斑布滿葉面，病斑合并，葉片枯死脫落。莖斑紡錘形或橢圓形，莢斑圓形或橢圓形，因莢上多毛，不易看到霉層。籽粒上的病斑與葉斑相似，多為圓形蛙眼狀。
防治方法：
⑴苗期較濕潤多雨的地區，用50%福美雙或50%多菌靈拌種，每100公斤種子用藥0.3公斤；
⑵針對感病品種，生長茂密的豆田，于發病初期或莢和籽粒易感病期噴藥，以控制籽粒上的病斑。常用藥劑有40%多菌靈膠懸劑或50%多菌靈可濕性粉劑，每畝用藥100克，或50%甲基托布津100克，兌水80公斤-100公斤-霧。視病情發展，間隔7天-10天，共2次-3次。
真菌病：有為害暗葉部的斑枯病、灰斑病、霜霉病和銹病等，其中霜霉病遍及各地；為害根、莖的有疫腐病、菌核病和炭疽病。疫腐病以抗病育種；其它靠輪作法防治。為害子粒的有紫斑病和黑點病，藥劑拌種防治。
細菌病：有斑點病和斑疹病，有的可用抗病育種防治。
病毒病：種類多，中國長江流域和黃淮平原以花葉病毒流行廣、為害重。采用無病毒種子、消滅媒介昆蟲及抗病育種防治。
大豆孢囊線蟲病、根結線蟲病：采用合理輪作和抗病育種防治。主要蟲害有食心蟲、草地螟、豆莢螟、豆稈蠅、豆稈黑潛蠅、紅蜘蛛和蚜蟲等，以藥劑防治為主。菟絲子在黃淮平原為害甚烈，采用清選種子、生物防治和輪作防治。
蟲害
大豆紅蜘蛛
危害特點：大豆紅蜘蛛主要是成、幼、若螨在葉背葉絲結網吸食汁液，受害豆葉初期呈黃白色斑點，逐漸變成灰白斑和紅斑。嚴重時葉片卷縮、枯焦脫落，嚴重地塊如火燒狀。受害豆株生長矮小，結莢小，豆粒變小。其防治措施如下：
農業防治：清除地頭、路邊及田間雜草和枯枝落葉，耕整土地以消滅越冬蟲源。合理灌溉和施肥，促進植株健壯生長，增強抗螨害能力。
生物防治：大豆紅蜘蛛的重要天敵有多種草蛉、塔六點薊馬、橫紋薊馬及一些瓢蟲、長蝽和蜘蛛等，在田間捕食紅蜘蛛，對其發生有一定抵制作用。
藥劑防治：加強蟲情檢查，控制點片發生階段。發現有零星豆株葉片出現黃白斑為害狀時，立即點片噴藥防治。可選用20%噠嗪硫磷乳油、20%三氯殺螨醇乳油、30%殺螨特乳油、40%水胺硫磷等稀釋成1000倍液，每畝噴50千克稀釋液；73%克螨特乳油1500倍稀釋液，每畝用藥液50千克。打藥注意噴頭朝上，上下噴透，噴勻。
地老虎
危害特點：幼蟲多從地面上咬斷幼苗，造成缺苗斷壟，主莖木質化后，取食近地面植株根部表皮，造成根部受傷，影響植株根部吸收水分，使植株逐漸萎蔫枯死。
農業防治：⑴選好茬口，前茬不宜選玉米地，應與小麥、水稻輪作倒茬。⑵及時秋翻冬灌，消滅蟲源，早春清除田邊地頭雜草。
誘殺防治：⑴黑光燈誘殺成蟲。⑵糖醋液誘殺成蟲。
化學防治：⑴噴霧：地老虎1-3齡幼蟲期抗藥性較差，且暴露在寄主植物或地面上，是藥劑防治的適期，可用90%晶體敵百蟲800-1000倍液、50%辛硫磷乳油800倍液、50%殺螟硫磷1000-2000倍液、20%菊殺乳油1000-1500倍液、2.5%溴氰菊酯（敵殺死）乳油3000倍液噴霧。⑵毒餌：多在3齡后開始取食時應用，每畝用2.5%敵百蟲粉劑0.5千克或90%晶體敵百蟲1000倍液均勻拌在切碎的鮮草上，或用90%晶體敵百蟲加水2.5-5千克，均勻拌在50千克炒香的麥麩或碾碎的棉籽餅（油渣）上，用50%辛硫磷乳油50克拌在5千克棉籽餅上，制成的毒餌于傍晚在菜田內每隔一定距離撒成小堆。
大豆毒蛾
危害特點：初孵幼蟲群集葉背食害葉肉，留下葉脈。以后便分散開為害，將葉片咬成缺刻和孔洞，當蟲口密度大時可將葉片全部吃光，造成植株衰弱，產量下降。幼蟲老熟后在葉背結繭化蛹，繭暗褐色。
防治方法：⑴燈光誘殺成蟲。⑵必要時噴灑90%晶體敵百蟲800倍液或80%敵敵畏乳油1000倍液，每667平方米噴對好的藥液75升。⑶提倡噴灑每克含100億孢子殺螟桿菌粉700-800倍液。
大豆食心蟲
危害特點：以幼蟲蛀食豆莢，幼蟲蛀入前均作一白絲網罩住幼蟲，一般從豆莢合縫處蛀入，被害豆粒咬成溝道或殘破狀。
防治方法：⑴敵敵畏熏蒸，在成蟲盛發期（當田間蛾量突然增多，出現打團現象即是成蟲盛發期。多數年份在8月12日到18日）每畝用80%敵敵畏乳油100-150毫升，將玉米穗軸或向日葵稈瓤截成約5厘米長段，浸足敵敵畏藥液，按每隔4壟前進5米1個藥棍的密度，將藥棍夾在大豆枝叉上。這種熏蒸法適用于大豆長勢繁茂、壟間郁蔽的大豆田，防效可達90%以上。⑵噴粉，用20%倍硫磷粉劑，可用2%殺螟松粉劑，或用1.5%甲基1605粉劑，或用3%混滅威粉劑，畝用1.5-2千克。⑶噴霧，用25%快殺靈乳油或其它菊酯類藥劑，每畝25-30毫升對水用背負式噴霧器將噴頭朝上從豆根部向上噴，使下部枝葉和頂部葉片背面著藥。這種方法防治成蟲，無論大豆長勢怎樣效果都很好。
大豆蚜蟲
危害特點：大豆蚜蟲具有趨嫩的習性。以成蟲和若蟲在大豆植株的生長點、頂葉嫩葉及嫩莖上刺吸汁液，嚴重時布滿莖葉，幼英也被為害，造成葉片卷縮，發黃，植株矮小，根系發育不良，分枝及結莢的數量減少，百粒重下降，產量降低，甚至整株死亡。
防治方法：⑴種子處理，用大豆種衣劑包衣，即可防治地下害蟲及早期蚜蟲。⑵噴粉，用1.5%樂果粉劑或1.5%滅好凈粉劑或2%殺螟松粉劑噴粉，每畝用量1.5-2公斤。⑶噴霧，用40%樂果乳油或50%滅蚜凈乳油或50%辛硫磷乳油1500-2000倍液噴霧。